① 考虑到填料由分析级直接放大到制备级的因素，如果要纯化大量的化合物，需要考虑分析柱的规格和可作为制备柱的填料粒径（10μm或更大）；作为在下一步纯化产品量更大的项目，必须考虑选择更大的填料粒径和更大内径的色谱柱，在与分析柱相同的填料下对产品进行纯化。
② 对分析柱（4.6mm内径或更小）选择性的研究，应在多种填料和多种色谱条件下进行选择，可以采用一些商品的液相色谱条件选择软件进行多种色谱模式的比较选择，这样可以缩短分离条件选择的时间。
③ 在得到的分离条件后，需要对分析柱上样品的承载量进行测试，比较多种上样量下产物的纯度，选择最理想产物纯度的上样量。
④ 选择制备柱的规格，要依据在分析柱上得到的上样量数据，进行放大分离，通常选择与分析柱相同粒径的填料和色谱柱长度来达到推测制备分离的预测。放大制备柱的上样量应基于制备柱和分析柱的交叉截面面积的比值来进行选择。
⑤ 检查制备色谱分离的结果和色谱馏出物的区域以及纯度。

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