磁分离技术处理废水存在如下的技术难度和局限性：介质的剩磁使得磁分离设备在系统反冲洗时，难以把被聚磁介质所吸附的磁性颗粒冲洗干净，因而影响着下一周期的工作效率，为了提高磁场梯度，必须选择高磁饱和度的聚磁介质，对聚磁介质的选择具有一定的技术困难，且增加运行的费用，利用外加的磁种增强了弱顺磁性或非磁性污染物的磁性，使其通过磁分离得以去除；利用外加的微生物吸附废水中的顺磁性离子，利用磁分离去除离子型顺磁性污染物。

尽管磁分离技术是一种简易可行且处理效率高的水处理技术，由于上述技术难度和局限性有待继续研究克服，因此，在实际应用中影响着它的广泛应用，与沉降、过滤等常规方法相比较，磁力分离法具有处理能力大、效率高、能量消耗少、设备简单紧凑等一系列优点，开发大水量、快速反应、效果稳定、与磁分离技术相结合的高效物化工艺，可显著提高氨氮、COD、SS等的去除率，进一步改善出水水质，改善河道水体环境，也是全面推进水体环境治理的关键问题。

城市污染，尤其是偏远的乡镇地区，水污染问题已经不容忽视，乡镇长期缺乏统筹规划造成环境污染问题日趋严重，尤其是城镇污水，这是困扰乡镇生态环境的重大难题，但是如果用超磁分离的话那就好多了，我们可以利用超磁分离将污水中的有害物质分离出来，可以达到水质净化的作用，不仅影响周围居民的生活环境，近年来，人口急剧增加，大量人口的涌入使得城市水资源总量不断减少，地表水系下降且干渠补充水源短缺，还对河道周边的土壤以及地下水造成污染。