当前段工序出现故障时，或其他有害金属离子进入污水处理系统，污水可直接进入磁混凝系统，系统仍然能够保持较高的去除效果，大幅度去除水中污染物；设备和工艺可以随时调整，灵活性强、占地小，可设置为流动式处理车间(如:流动设备处理车、活动板房等)，可根据需求装置指定地点，或建固定厂房等；投资低，比膜处理有明显的优势，而且磁粉可回收并在系统中循环使用，回收率99%；运行成本低，设备使用寿命长，除了正常的维护外，不用更换部件而造成高昂的二次投资。

我国在城市污水处理、中水回用、自来水处理、河道水处理、高磷废水处理、造纸废水处理、油田废水处理等方面对该技术的中试已经完成，均取得了较好的结果，也能结合生物工艺非常有效和经济地脱氮；耐冲击负荷能力强，对水质的冲击有独特的耐冲击能力，磁种的离子极性和金属特性,作为絮凝体的核体,地强化了对水中悬浮污染物的絮凝结合能力,减少絮凝剂用量,在去除悬浮物,特别是在去除磷,细菌,病毒,油,重金属等方面的效果比传统工艺要好。

在原有设备的基础上，加装或将工艺改造为磁絮凝系统，只需更改其核心部分，提高其处理能力，降低运行成本；运行管理方便，启动快捷，运行管理简单，应用场景有污水厂提标改造、污水应急处理、企业污水站提标改造、应急净化处理（饮用水）、深度除磷浊度悬浮等，在经济不发达的广大农村地区，建设净水厂不经济，可采用移动式的磁絮凝工艺设备进行供水;对突发性水质恶化情况，可采用磁絮凝工艺设备进行紧急供水;对于野外作业，可采用磁絮凝工艺设备进行供水。