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Gaussian量化模拟:实例操作之自旋多重度的判断,在修改Gaussian输入文件时,自旋多重度往往是困扰入门者的难题,换言之,只要能够知道模型分子的电子占据情况,即可算出该体系的自旋多重度,简单体系,对于比较简单的体系,可根据原子或分子轨道理论来判断,根据计算所得的静电势,可进一步结合VMD软件进行处理,还可以得到精美的分子静电势分布图。
Multiwfn(http://sobereva,com/multiwfn/)则是sob老师开发的,功能极为强大的波函数分析软件,该软件可以极为方便的从计算输出文件中提取出我们所关注的信息,极大简化数据分析的难度,上述三个软件的安装在Windows系统还是Linux系统下均不困难,按照软件安装教程的步骤即可顺利安装,请注意在所有安装路径中不要出现中文,也建议不要出现空格(可用下划线“_”代替空格)。
输入文件:文件后缀名通常为,gjf,包含模拟任务的计算资源分配(核数、内存使用情况)、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息,输出文件:文件后缀名通常为,out或,log,除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外,还包括了部分计算过程中输出信息,对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态,如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等,均为开壳层体系,自旋多重度大于1,需做进一步判断。