“%chk=”命令用于指定计算输出的，chk文件的命名（H2O，chk）以及保存路径（，/在Linux系统中代表当前文件夹，当然也可以写上完整路径），该路径需实际存在，否则在后续计算过程中会报错，事实上这一部分内容可以根据实际需要写的更为详细，例如：，接下来在Xshell端输入“cd/home/gauss/user/simulation/H2O_opt”并回车，进入该文件夹，随后输入“g09

可载入GaussView中，对计算结果或计算过程中的一些结构变化进行分析，检查点文件：文件后缀名通常为，chk或，fchk，包括轨道系数、密度矩阵等输出文件中未涵盖的重要信息，可载入Multiwfn进行数据分析，读写文件：文件后缀名通常为，注：在未特别说明的情况下，本文中涉及到的所有量化模拟实例均是在本地电脑（Windows系统）建模并生成输入文件，在服务器（Linux系统）中进行计算，在本地电脑进行数据处理和分析。

输入文件：文件后缀名通常为，gjf，包含模拟任务的计算资源分配（核数、内存使用情况）、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息，输出文件：文件后缀名通常为，out或，log，除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外，还包括了部分计算过程中输出信息，对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态，如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等，均为开壳层体系，自旋多重度大于1，需做进一步判断。