“%chk=”命令用于指定计算输出的，chk文件的命名（H2O，chk）以及保存路径（，/在Linux系统中代表当前文件夹，当然也可以写上完整路径），该路径需实际存在，否则在后续计算过程中会报错，事实上这一部分内容可以根据实际需要写的更为详细，例如：，接下来在Xshell端输入“cd/home/gauss/user/simulation/H2O_opt”并回车，进入该文件夹，随后输入“g09

Multiwfn（http://sobereva，com/multiwfn/）则是sob老师开发的，功能极为强大的波函数分析软件，该软件可以极为方便的从计算输出文件中提取出我们所关注的信息，极大简化数据分析的难度，上述三个软件的安装在Windows系统还是Linux系统下均不困难，按照软件安装教程的步骤即可顺利安装，请注意在所有安装路径中不要出现中文，也建议不要出现空格（可用下划线“_”代替空格）。

输入文件：文件后缀名通常为，gjf，包含模拟任务的计算资源分配（核数、内存使用情况）、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息，输出文件：文件后缀名通常为，out或，log，除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外，还包括了部分计算过程中输出信息，对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态，如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等，均为开壳层体系，自旋多重度大于1，需做进一步判断。