ubi20z任务的计算方法和内容部分,“#”指以正常形式输出计算结果,若希望以更为详细的形式输出结果,可写作“#P”,若希望以精简形式输出,可写作“#T”,“b3lyp”决定本次模拟采用DFT方法并选用b3lyp泛函进行计算,泛函应根据实际需要进行选择,此处给出的较为通用且精度尚可的杂化泛函,例如Summary中包含了当前帧的基本信息(电子自旋、能量等),Optimization可显示优化过程中体系的能量和平均受力(RMS)变化情况。
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无论是DFT还是HF方法的模拟,均需选择合适的基组,此处给出的是较为通用且精度尚可的基组,【前缀】【主词】【后缀】关于基组的选用,可参考sob老师的文章“http://sobereva,com/336”,“opt”指本次模拟的具体任务为结构优化,这些命令可根据情况连用,例如“optfreq”表示首先进行结构优化,随后对优化的结构进行振动分析,该值根据实际计算情况修改即可,例如计算一个Cu2+时为2,计算苯分子时为0,计算一个SO42-时为-2。
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输入文件:文件后缀名通常为,gjf,包含模拟任务的计算资源分配(核数、内存使用情况)、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息,输出文件:文件后缀名通常为,out或,log,除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外,还包括了部分计算过程中输出信息,对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态,如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等,均为开壳层体系,自旋多重度大于1,需做进一步判断。