ubi20z空格可用下划线代替,例如“H2O_O2,gjf”,“Graphene_NH3,gjf”,接下来,我们以上图为例介绍Gaussian输入文件(,gjf)中所包含的信息,主要涉及到5部分内容:,计算资源分配及输出结果保存部分,倘若我们要对一个Fe3+进行模拟,但并不知道自旋多重度应取何值,且不擅长或无法通过轨道理论进行判断,那么可以通过计算Fe3+在不同自旋多重度下的单点能的方式来寻找其基态自旋多重度。
若该值设定不合理,则计算出来的结构并非基态,这一部分内容会在后文中详细介绍,此处仅给出一个简单的判断标准,对于大多数不包含过渡金属的基态分子,例如水、苯、SO42-、常规有机体系等均为闭壳层体系,其自旋多重度为1,模型,该体系中包含的1个O原子和2个H原子,以及这三个原子各自的笛卡尔坐标,对比修改前后的输入文件,可以看到我们删除了第2行中“geom=connectivity”字样和11-13行的内容。
输入文件:文件后缀名通常为,gjf,包含模拟任务的计算资源分配(核数、内存使用情况)、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息,输出文件:文件后缀名通常为,out或,log,除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外,还包括了部分计算过程中输出信息,对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态,如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等,均为开壳层体系,自旋多重度大于1,需做进一步判断。