在缺血性脑卒中有大约40%原因不明，卵圆孔未闭为可能性原因，在2014年国际脑卒中大会上，TCD诊断卵圆孔未闭技术被认为是2014年神经病学届三大重要发现之一，被认为是诊断卵圆孔未闭新的金标准。

　　目前已经知道临床许多疾病，如血管性、功能性头晕、眩晕、神经官能症、自主神经功能紊乱等均与脑血管功能紊乱有密切关系，经颅多普勒的检查对这类功能性疾病的病因学诊断有极重要的诊断价值，并可为临床治疗提供客观的依据。

　　TCD对于颅内血管狭窄、闭塞诊断的优势已经得到公认，但对于颈部血管病变的诊断、评估，同样有价值，尤其是对于颈总动脉或颈内动脉中度狭窄和重度狭窄的区分上，关系着治疗方案的选择和病情评估。仅仅依靠MRA或者颈部血管彩超应用形态学或者狭窄部位本身的血流速度来判断狭窄程度是不够科学的，必须通过狭窄部位远端有没有低搏动改变来判断，而TCD可以准确、简便的提供这项数据。

　　锁骨下动脉盗血综合征是指在锁骨下动脉或头臂干的椎动脉起始处的近心段有部分的或完全的闭塞性损害，由于虹吸作用，引起患侧椎动脉中的血流逆行，进入患侧锁骨下动脉的远心端，导致椎-基动脉缺血性发作和患侧上肢缺血性的症候。TCD对于盗血的诊断是敏感的，远远高于DSA和血管超声，而且可以进行功能试验，判断是不是真正的盗血，对于既往所谓的隐匿型盗血，TCD下无所遁形。