长期以来，农村厕所多以旱厕为主，非常简陋，粪便很难做到无害化处理，对水源和环境造成严重污染。粪便中含有大肠杆菌、痢疾杆菌、霍乱狐菌、伤寒杆菌等致病细菌；有肝炎病毒、灰质炎病毒等；有蛔虫、绦虫、血吸虫、钩虫、肝吸虫、鞭虫等寄生虫；孳生蛆及苍蝇。据专家介绍，在农村有80%的传染病是由于厕所粪便污染和饮水不卫生引起的，而与粪便有关的疾病就有30多种。目前，欧洲流行的溶血性大肠杆菌传染病就是粪便污染周边环境造成的。农村改厕防病的形势相当严峻。
进入新世纪以来，随着国际社会和民众对环保越来越重视，国家对农村改厕工作十分重视，国家在“十一五”规划和对联合国“千年发展目标”承诺中明确提出农村改厕目标，即到2010年农村卫生厕所普及率达到65%，到2015年达到75%。从2004年开始国家设立中央转移支付农村改厕项目，2009年国家又将这个项目提升为重大公共卫生服务项目。建设改造标准也按无害化方向进一步提高，即达到有棚有墙、不渗不漏。
粪尿分集式厕所。粪、尿分别收集、处理和利用。粪便用草木灰、炉灰、黄土等覆盖料覆盖，促进粪便无害化。这种类型是由世界卫生组织、瑞典卫生署推荐推广的、无害化处理效果的技术模式，也是卫生部门近年来大力推广主推模式。
八十年代前农村环境，清澈的小溪乡间流淌，孩子们在河塘中抓鱼嬉水的美好景色已经被污染地一去不复返了，如今村村都变成了黑河沟。先污染后治理的传统水冲厕所既浪费自来水，还造成大量的粪水排放。其对生活环境的破坏不是一朝一夕显现出来的，此生态卫生厕所几年前在全国10多个省市推广使用以来，深到了各地用户的喜爱。
2004年以来在国家的支持下，爱卫会充分发挥项目带动作用，因地制宜，因势利导，稳步推进，掀起了新一轮农村改厕高潮，改厕管理和技术水平不断提高，农民群众改厕积极性空前高涨。截至目前，在农村402.8万户中，卫生厕所294万个，普及率73%。近三年实施了国家医疗体制改革重大公共卫生农村改厕项目，重点推广粪尿分集式无害化卫生厕所55万个，普及率达13.7%。在1000个新农村建设省级示范村中，目前在商贸集聚中心、旅游景点、人口集中居住区建成公共卫生厕所3137个，农户卫生厕所34.82万户，普及率达到85%以上，高于平均水平12个百分点。其中建成室内卫生厕所2588个，粪尿分集式卫生厕所67313个，两项合计69901个，占1000个示范村40万农户的17.5%，粪尿分集式占16.8%，高于平均水平10个百分点以上，说明无害化卫生厕所已重点向新农村建设示范村履盖。
调查中了解到，目前重点推广的粪尿分集式卫生厕所有以下几个特点：一是基本适合北方寒冷地区。目前还没有比粪尿分集式厕所更适合推广应用的。尽管这种厕所冬天有尿贮存、处理不便的问题，但是通过移动缸体、摔尿桶、定期清尿冰等措施，可以解决冬天应用问题。二是投资比较合理。我们对2010年双阳区奢岭街道前城村兴建的彩钢粪尿分集式厕所的成本进行了全面分析，具体是：需红砖550块，支出220元；水泥3袋，支出75元；河沙及运费35元；贮粪池开挖和砌筑人工160元；厕所地面漏空水泥预制板80元；彩钢棚、墙、门、贮粪尿池盖板和安装人工800元；排气管、排尿管30元；瓷制便器70元；合叶、门锁等小料10元，共计1490元。2011年双辽市新立乡荷花村建设的红砖粪尿分集式厕所每个成本1200元。比陕西省推广的双瓮漏斗式厕所每个成本4000~5000元，降低70%左右。三是实际应用效果比较好。主要是做到了粪便处理无害化，消除了蚊蝇滋生和厕所恶臭，减少了居室蚊蝇侵扰和传染病传播。四是受到农民的欢迎。
加快推进农村改厕对于保护生态环境、改变农村面貌、培育文明风气、保护和提升农民健康和文明素质、扎实推进新农村建设，具有重要意义，是利国利民的重大民生工程，应加大力度、强化投入、加强引导、积极推进。
