面对越来越多的古建筑被破坏事件在不同地区发生的情况，方振宁先生认为，如今在古建筑的保护过程中不少问题亟待解决。
首先，法律跟不上，我们对于文物或者不可移动文物的认定速度慢。有一些古建筑没有被纳入其中，法律法规能够包括的范围非常有限，使得一些没有被纳入不可移动文物的房子被拆。所以，对于这些文物或许可以分为几类：不可移动的、具有史迹性的等等。要不断的增加项目，比如联合国文化遗产，不可能一年把世界上所有的文化遗产全都需求，每年都会有不同的申报。另外，比如出土的、在施工过程中发现的像长沙古城墙，这些以前不知道的，专家们觉得非常重要的发现，就需要立刻纳入保护范围之中。
第二是在进行重大项目时，需要进行公民投票，通过民主的方式广泛征求意见。
在此之后就是透明性，不能偷偷摸摸的，在没有告知的情况下就对古建筑进行大面积的施工。需要写清项目的名称、许可、施工单位、负责人及联系方式、竣工后的效果图及投诉电话等。
另外，最重要的是教育，这不是法律能够解决的问题，要提高普遍的教育水准，同时也需要媒体的监督。
在进行了多年古建筑保护的努力之后，仍然有大量的古建筑遭到破坏。对此方振宁表示，自己依然会坚持下去，'如果我能通过媒体让大家知道，让更多的人觉悟，学习着去保护这个城市、建筑，或者说有书留下来，这就是努力的结果。'