生殖是有机体极为重要的生理机能，并且保证种的延续。的生殖器官行使着繁殖后代的机能。
　　1、母纯种藏獒的生殖器官：母生殖器官的结构及位置：
　　卵巢：位于腰的下区，在第4—5腰椎之下，卵巢有两枚呈椭圆形，分别在左右子宫角的两端，借卵巢韧带和子宫相连，和输卵管漏斗形的伞相接触。其功能是产生卵子和分泌激素。卵巢的结构是由皮质组成，外有被膜包围。
　　输卵管：是连接卵巢和子宫的管道，滤泡在卵巢内成熟后，就沿输卵管移动而进入子宫角内。
　　子宫：是胎儿发育的地方。子宫是中间空的肌肉性器官，向前与输卵管连接，向后通向阴道，下有膀胱，上有直肠，子宫的大部在腹腔中，小部分在骨盆中。整个子宫分为一体、一颈、二个角。的子宫体很短，而子宫角很长，从外形上看子宫很像英语字母“Y”。
　　阴道：就是与子宫相通，排出胎儿和尿液的通道。上面有直肠，下面与膀胱、尿道相接触。阴道的结构有两层， — 层是纵向肌纤维层，一层是环向肌纤维层，其粘膜多褶富有弹性，但无腺体。
　　阴户：其位置位于肛门和耻骨之间，其形状为一垂直裂缝，两侧有阴唇。其上端连合处呈锐角，两唇下端连合圆而厚。其结构外皮甚薄，平滑而有色，内有许多皮脂腺及汗腺，皮下为一层横纹肌，对阴户起收缩作用。
　　2、公纯种藏獒的生殖器官：
　　睾丸与副睾：睾丸有一对，位于阴囊中，呈卵圆形，两侧略扁平，其组成主要由弯曲的精细管，这种精细管是由睾丸的腺体组织所组成，功能是产生精子。
　　副睾与睾丸密切相连，是一个弯曲的管，头部和睾丸输出管相连，尾部和输精管相接，其机能是使由睾丸精细管排出的精子在此存留一个时期，而使精子的发育更充分、更完善，同时副睾的分泌物有助精子的活动。
　　输精管：形状似导管，由发达的平滑肌组成，故有射精作用。一端和副睾尾相连，另一端位于膀胱上部，通过精囊移行于骨盆部尿道，射精时由尿道排出。
　　前列腺(摄护腺)：位于膀胱颈及尿道的连续部，亦为腺体所组成，具分泌功能，为增强精子活力。
　　阴茎：阴茎是交配器官，分为阴茎根、阴茎体及阴茎头 3部分。阴茎是由海绵组织构成的。海绵组织于静脉充血时扩张，且具有弹性，因此阴茎的体积可以增大也可以伸长，当阴茎处于这种状态时称为勃起。阴茎的末端是一个较长的龟头，其中有小块骨。