纯种藏獒内分泌腺是没有导管的腺体，上皮内产生的激素直接分泌在血液中，对机体代谢、生长发育、生殖等机能起着重要的调节作用。
　　内分泌器官有脑垂体、松果体、甲状腺、上皮小体、脑胰脏、肾上腺、睾丸以及卵巢等。
　　1、脑垂体：位于脑的底部，在垂体窝中。分为前叶和后叶。通过其它内分泌腺的刺激和调节作用，影响机体生长、发育、新陈代谢和生殖活动。前叶又称腺垂体，分泌许多激素，为促甲状腺激素、促肾上腺激素、促性腺激素等。后叶又称神经垂体，分泌加压素和催产素。
　　2、甲状腺：有一对，位于气管两侧第2—3气管环，分泌甲状腺素和降钙素，具有调节代谢的功能。甲状腺具有促进蛋白质的合成、肝糖元的糖化、胆固醇的合成和胆汁酸的生成等，有提高基础代谢作用。
　　3、上皮小体：分泌甲状旁腺激素，这种激素主要维持有机体内钙盐的正常代谢。
　　4、胸腺：在胎儿和幼年动物，位于胸腔的前部、颈椎下方的前纵隔内及气管的下面。胸腺逐渐萎缩，成年动物完全没有。具有淋巴器官的作用，与抗体形成有关。
　　5、肾上腺：有一对，位于肾脏的前内侧。肾上腺有皮质和髓质。皮质分泌皮质激素，主要功能是调节代谢和维持生命。髓质分泌肾上腺素，具有增强心血管系统的活动，抑制内脏平滑肌以及促进糖代谢的机能。
　　6、胰脏：胰岛细胞分泌胰岛素，主要作用是促进肝糖兀生成和蓄积，促进糖的利用、糖的脂肪化等。
　　7、松果体：其作用还不清楚。松果体分泌抗黑变激素，与调节光环境和生物节律有关