送风口由于缺少了高效过滤器阻尼作用，送风口的流速与噪音必然增大，因此未端采用了双层扩散板静压箱送风方式。排风采用房间四角下侧均匀排风的方式，排风管道是活动可卸的，以利于定期清洗与检修。
　　室内的温湿度控制主要由空调箱内的表冷器、加热器、加湿器、风管末端的再加热器和再加湿器来控制。表冷器、加热器及加湿器上的电动调节阀通过总送风管上的温湿度传感器控制，而再加热器和再加湿器则由房间内的温湿度探头直接控制。
　　室内的压力主要通过送风管上的定风量装置CAV、排风管上的定风量装置CAV控制。同时，为了保证系统运行初始的风量与运行一段时间后的风量一致，空调箱内的送风机与排风机均采用变频调速控制。
　　中央空调改造公司为了有效排除动物房中的异味，空调系统采用了全新风系统，为解决由此而带来的能耗问题，在空调箱与排风箱内各加入一段显热回收装置，利用已二醇溶液作为介质，限度地回收热量与冷量。
　　由于动物房要求空调系统24小时不间断运行，因此空调系统的电源接入应急电源系统，空调箱内的风机采用一用一备的方式，排风箱也采用一用一备的方式，以备在紧急情况下使用。