1、选用无病种藕栽种 南阳雪莲藕种雪莲藕带菌是腐败病发病的主要菌源，预防该病，关键要从无病雪莲藕藕田选择健株作种藕，杜绝菌源，在植藕前，种藕用50%多菌灵或甲基托布津800倍液，或75%百菌清可湿性粉剂800倍液喷雾后，用塑料薄膜覆盖密封闷种24小时时，晾干后播种。
　　2、清除病株 彻底清除发病雪莲藕藕田病株及病残体，并深埋或集中烧毁。植前每亩施生石灰50-100公斤，既杀菌清洁田园，又可加速有机肥的分解。
　　3、合理施肥 基肥应以有机肥为主，肥料必须充分腐熟。对土壤酸性重、南阳雪莲藕还原性强的土壤中，宜重施石灰，石灰要早施、多施。生长期间注意氮磷酸肥的配合施用，有条件地方应增施硅质肥，提倡补施硼、锌、钼等微肥，切勿偏施化学氮肥，以提高雪莲藕植株抗病能力。
　　4、科学管水 生病期深水灌溉，降低地温抑制病菌繁殖。留种莲田每天保持深水浸泡，切勿排干水和冬翻晒垡。非留种田在采完南阳雪莲藕莲子后一律砍伐荷梗翻耕或挖雪莲藕，栽上一季冬作物。不种冬作物的也要翻耕灌水浸田，减少土壤及病残体的带菌。