咖啡最早进入日本，是由荷兰传教士和商人带来的，时间大约在1630年左右，也就是荷兰人拼命向他们在亚洲的殖民地斯里兰卡和印度爪哇推广咖啡时。不过日本人完全不接受这种怪异的的饮料。直到明治维新时代，日本社会掀起“西学”之风，人们才在渐渐接受先进的西方工业化文明的同时，接受了他们的生活方式之一：咖啡。最早的咖啡馆出现在“会馆”里，也就是专门接待外国使节下榻的宾馆里，这些会馆，大多位于港口城市如神户、横滨等地。此后，咖啡逐渐进入到日本上流社会的生活中，成为“饮料”。在1883年，日本为了迎合西洋达官显要的需要，特地建造的豪华宾馆“鹿鸣馆”，宴会上的一切均按照“法式全餐”模式进行，从开始的餐前酒到最后的咖啡，都正式列入菜单。

像欧洲一样，19世纪末最早的咖啡馆，总是汇集大批的文人墨客，在那里花只有餐厅三分之一的价钱买一杯咖啡，谈天说地。而与此同时，在这个以茶道著称的国家里，也不可避免地出现针对咖啡的抨击。比如说当时民间流行的一种叫做“黑白节”的传唱，其中有一段写道：“悄悄的伸出西洋鼻子，不喝清酒，反要啤酒白兰地，以茶道庄严肃穆的表情喝咖啡，真好笑！”但与庄严肃穆的茶道比起来，随意性很强的社交场所咖啡馆显然是年轻人和激进分子的。咖啡迅速成为炙手可热的大众饮料。

世界上最最贵的咖啡在日本，而最通俗的咖啡也在日本，除速溶咖啡外，日本是最早推出罐装（液体）咖啡的国家。此外，日本是惟一一个设有咖啡节的国家，每年10月1日都要举行庆祝活动.