在物流活动过程中，运输、仓储、流通加工、包装、装卸搬运等除了创造空间效用和时间效用之外，也会对环境造成不好的影响。
1、运输对环境的影响
    作为物流活动中最主要、最基本的活动，运输会对环境造成严重污染，具体表现在：交通工具本身产生的噪声污染、大气污染、废机油污染、交通堵塞等；不合理的物流结点布局，加剧了废气和噪音污染；企业自营物流比例大，第三方物流比例小，造成了社会运输车辆过多，引起空载运输、对流运输、迂回运输等不合理现象。
2、仓储对环境的影响
    作为物流活动中第二重要的活动，仓储在创造时间效用的同时，也对环境造成一定程度的污染，具体表现在：对仓库等物流结点中的部分产品进行保管养护的过程中，需要采用化学方法，而化学药剂会对周边生态环境造成污染；另外，一些易燃、易爆、易腐蚀、有放射性的危险品，由于保管不当，也会对周边环境造成污染和破坏。
3、包装对环境的影响
    在物流活动中，包装主要承担保护商品、促进商品销售功能的作用，但包装不当会对环境造成严重影响，具体表现在：包装材料选择不当、包装过度或重复包装。有些包装材料，特别是用塑料作为包装材料，在使用之后，若不对其进行处理，在自然界中需要相当长的时间来分化，会对环境造成长期污染，影响人畜生命安全。另外，过度的包装或重复的包装，造成资源的浪费，同时废弃的包装材料还是城市垃圾的重要组成部分，处理这些废弃物要花费大量人力、物力、财力。
4、流通加工对环境的影响
    流通加工是物品在生产地到使用地的过程中，根据需要施加包装、分割、计量、分拣、刷标志、拴标签、组装等简单作业的总称。作为物流活动中可以创造产品价值增值的活动，流通加工会对环境造成严重的影响，具体表现在：流通加工过程中，产生的大量边角余料难以集中有效再利用，造成对环境的污染；另外，流通加工的节点选择不当，本应选择靠近消费者，结果选择靠近生产者，从而增加了运输路线和运输量，产生新的污染。