一般来说，要有空气进入水桶内形成负压，饮水机才会顺畅出水。所以，有多少水流出，就有多少等体积的空气进入桶内。空气进入饮水机后会造成二次污染，细菌会趁机繁殖，从而对人体健康造成危害

同时，热水胆反复加热形成的“千滚水”中含有重金属等，这些有害物质和水垢会在饮水机内越存越多，导致水质不断恶化。人如长期饮用这种水，容易患上肠胃病等疾病。

北京公众健康饮用水研究所所长李复兴教授说，水体中的藻类和病菌，在经过一定时间的繁殖之后，会导致净水器和饮水机的二次污染。

此外，有些净水器带有活性过滤炭，独具的吸附作用也存在一定的安全隐患，长期使用饱和后，也会容易滋生微生物。李教授提醒说，清洗时要加入酸性的物质（柠檬酸等）或清洗剂。所以，美的饮水机专家建议，夏天至少要每月清洗一次。

另外，饮水机应放置到避光的地方，阳光的高温照射，会加剧水中微生物的繁衍，桶装水一周内喝完。