水下清淤时应注意纠偏幅度不宜过大，频率不宜过高。 水下清淤制作底节沉井围堰，浮运至墩位处定位，通过水上起重设备起吊，放入水中浮起，并用导向船和缆绳将其在流水中定位，在向空壁中注水压重下沉并逐层接高压重，同时吸泥下沉。 水下清淤当围堰下沉至岩面时，可以将刃脚与岩面空隙填实，再向空壁中注水压重使其不再悬浮。

河道淤泥处理工程有效改善了航道通行与河流生态，而产生的淤泥成分复杂，简单通过疏浚填埋方法进行处置，不仅耗费大量运输成本、占用大量土地，且容易造成环境的二次污染。探索有效的淤泥处置利用技术，以达到淤泥处理的减量化、资源化和无害化目的将会是一项重要的任务。 就是将污染较低的废弃淤泥运输至特定抛置区倾卸，经过水体的不停降解和交替作用，而不会对水体环境造成致命性破坏，从而降低淤泥对水体的污染程度。这是长期以来处理海相沉积淤泥常用的方法。将疏浚航道挖出的淤泥强力吹填到围堤中，经过沉积固结处理，形成大面积陆域，供港口建设使用。

河道淤泥处理的化学固化技术因其较低的处置成本低，且处置过程无污染、资源化利用效率高、固化体稳定性好等优点，成为我国大力支持的河道淤泥处置技术。然而，由于河道淤泥含水率和有机质含量均较高，严重影响了固化效果和固化体的强度，开发高效绿色的新型固化材料，成为支撑河道淤泥无害化利用的关键。