看看谷壳的颜色，雄性保持系颜色比较均匀，杂交种水稻种子在颖壳上有略不均匀的黄褐色斑点。保持系和其他混合种子比水稻种子透明。看种子的纯度。用手挑选种子时，如果指尖间出现土粒、砂粒等固体颗粒及其他杂质，并有细粉，则说明种子不符合国家标准的纯度。杂种是异花授粉的，柱头外露。仔细看纹路中间和外侧的裂缝，发现一个小黑点，这是柱头痕。这是鉴别杂种水稻种子和其他水稻籽粒的重要依据。

影响水稻种子发芽的内外原因，水稻种子要发芽，必须具备两个基本条件:一是种子本身具有发芽能力；二是要有合适的外部条件。影响水稻种子发芽的内在因素:水稻种子发芽是胚茸和胚根冲破谷壳开始生长的过程。胚的活力是种子萌发关键的内在因素，胚乳是胚生长发育所需营养物质的提供者，也是种子萌发的重要内在因素。此外，胚的活力和发芽的均匀性与种子的成熟、后熟和寿命密切相关。种子成熟度:一般来说水稻种子越成熟，发芽率越高，发芽越有序。

影响水稻种子发芽的外部因素:水稻种子除了种子本身的内部因素外，休眠状态向发芽状态转化还需要三个重要的外部条件，即水分、氧气和温度。只有科学地协调种子与水、氧、温的动态平衡，才能很好地浸种催芽。水:水稻种子吸水是发芽的第一步，即浸种是促进种子吸水的一个技术措施；干燥后的种子处于休眠状态，只有吸收足够的水分后，种子中的生理生化功能才能逐渐开始。种子吸水有三个作用:一是使种皮膨胀软化，有利于溶于水中的氧气随水渗入水稻种子细胞，增强胚和胚乳的呼吸作用。