由于马自达汽车公司长期的极度追求产量、产品技术和市场扩张，在持续的巨额投资后，又恰逢20世纪90年代初日本出现经济泡沫，1995年，该公司首度出现经营性巨额亏损并一度名列日本第二亏损企业，年度亏损达1552亿日元，而此种亏损一直持续了6年。

此时，占有马自达公司20%股份的合作伙伴福特公司伸出了援助之手，马自达的外国ceo马克·菲尔德于2000年11月领导制定了马自达“新世纪计划”，旨在建立能够适应不同市场需求的汽车公司，通过强大的产品阵容来确保未来的持续发展。

该计划有4个核心：市场、产品、财政和人才培养。新的计划实施后，产量下降了15%。2002年，马自达实现净利润6500万美元，是1982年以来盈利最多的一年。2008年，马自达在日本本土拥有1.85万名职工，以及广岛和防府两个制造基地，在横滨有一家研发中心；在海外，马自达在美国、泰国、南美和中东等地建设了19座工厂，其中，在美国设有一个研发中心。

1992年以后，马自达尝试进入中国市场，一汽海南马自达开始投入运转，并推出了福美来、普利马两种车型，在2005年推出马自达3。2006年与海南汽车的合作终止。

2002年5月，继承了马自达品牌内在精神的m6问世。在日本市场一露面，它就受到了日本各界人士的青睐，短短的两个月内创造了销售10000辆的突出业绩。m6在竞争十分激烈的欧洲市场上也一路，创造了有史以来的3.6万辆的销售业绩，令欧美的汽车制造商和经销商们大为震惊。