通过对菊花品种分类的一般认识，我们便可以大体了解菊花品种的极大的多样性。菊花品种的极大多样性，吸引了许多的分类工作者们去探讨菊花的原祖。或认为Dendranthema indicum (L.) Des Moul. 是菊花的原始祖先，或认为Dendranthema lavandulifolium (Fisch. ex Trautv.) Ling et Shih是原祖，或认为它的原祖是Dendranthema chanetii (Levl.) Shih，或者开出一系列的可能的原祖名单。我国科学工作者有的还进行过属间杂交实验，在探讨菊花真源方面做了一些推测性和实验性工作。无论推测和实验，都是试图把菊花的来源落实于本属的某一个或某两个种上，并且试图指出，在这些浩瀚的品种中，哪一个品种最为原始，即是说，想找出最原始的菊花品种。 [6]
但是，我们必须指出，似乎可以肯定，菊花的来源是多方面，即是说多元的，不是单元起源的。断不能用简单化的方法来概括。菊花是异花受粉植物。人们在长期的实践过程中，运用种间，甚至属间杂交的办法，来获取菊花的新性状，并通过返交、互交等有性过程来获得新性状的分离。这样如此返复的遗传重组合和性状的分离，新性状就越来越多。在这个过程中，有意识的人工杂交和随机的自然选择都可以同时出现或交替发生。但是，去劣择优的人工选择过程，却永远起着主导作用。菊属的其他种的细胞染色体资料，说明这个属的种间是非常容易杂交的。但是，非常遗憾，对菊花染色体的记录是极其有限的。仅记录到的，菊花是6倍体，2n=54。还必须指出，菊花新品种产生的另一个可能的途径是体细胞的突变（芽变），用固定芽变的办法来获得新品种。 [7]
因此可以相信，菊花是一种多来源的，是通过人们长期的定向（主要是取其观赏价值）的人工选择的杂种混合体。确信，未来对菊花诸品种以及菊花以外的邻近属的细胞遗传学的研究，定能揭示菊花的来龙去脉。 [8]
然而，尽管如此，作为长期的人工选择的结果，菊花应该与自然发生的种等量齐观，即是说，应该与自然种等值地、独立的作为种看待。 [9]
这是很清楚的还是利用菊花的有性繁殖（人工的或自然的昆虫传粉）借助遗传重组合和性状分离或基因突变，来进行新品种的选择，而利用无性繁殖的方法，来固定新性状，培育新品种。菊花的无性繁殖法有扦插、分枝、压条等。扦插是普通的方法